DJI Modifyで新規プロジェクトを作成後、プロジェクトフォルダを移動できますか？

はい、移動可能です。しかし、移動したプロジェクトは、プロジェクトリストに表示されません。そのプロジェクトをDJI Modifyに再度インポートする必要がございます。